La recherche est parmi les activités phares du CCJT-SH. C’est même le volet central de ses activités en tant que laboratoire des réflexions et des conseils (Think Thank). Dans le but d’assurer la liaison entre la recherche académique et les politiques publiques que le Gouvernement congolais est censé mettre en place en faveur du développement du pays, le CCJT-SH a fait de la recherche un de ses chevaux de bataille. C’est ainsi qu’il produit une revue scientifique à comité de lecture dénommée Revue Congolaise de la Justice Transitionnelle/Congolese Journal of Transitional Justice (RCJT-CJTJ) dont le premier numéro avait vu le jour en novembre 2018 avec des articles consacrés aux groupes armés dans les territoires de Kalehe (groupements de Buzi, Mpinga Nord et Mbinga Sud) et de Walungu (groupement de Mulamba) dans la province du Sud-Kivu avec l’appui de la Synergie des initiatives des Grands lacs (SYNIGL) avec le financement de l’USAID à travers son projet SPR. A côté de sa revue annuelle (RCJT/CJTJ), le CCJT-SH produit également de manière ponctuelle des documents d’orientation politiques (policy papers) et des policies briefs sur. Les questions d’actualité et les questions brûlantes en vue d’influencer les décideurs politiques de la République Démocratique du Congo et de la région des grands lacs dans sa globalité.